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細菌內毒素（endotoxin）由革蘭氏陰性菌所產生、存在于菌體內的一類毒素，是菌體細胞壁的組成成分。細菌在生活狀態時不釋放，只有當菌體自溶或用人工方法使細胞裂解后才可釋放出來，它不是細菌的代謝產物。細菌內毒素的化學成分是磷脂-多糖-蛋白質復合物，其中主要成分是脂多糖（lipopolysaccharide，LPS），位于細胞壁的最外層，覆蓋在細胞壁的粘肽上。脂多糖由三部分組成：O-特異性鏈、核心多糖和類脂A。

   O-特異性鏈：向外由若干個低聚糖的重復單位組成的多糖鏈，具有特異性。

   核心多糖：分為內核心及外核心，外核心由數種單糖，包括葡萄糖、半乳糖、乙酰氨基葡萄糖等組成。內核心含有庚糖及特殊的KDO（3-脫氧-D-甘露糖-辛酮糖）。KDO以不耐酸的酮糖鍵與類脂A的氨基葡萄糖連接。所有G-菌都有此結構。
   類脂A：位于最外層，具有致熱作用，是細菌內毒素的毒性成分。游離的類脂A含有疏水性的中心及親水性的邊緣，是一種雙相分子，可自身凝集成高分子的復合物，其分子量大小不等。
   LPS是由親水性的多糖和疏水性的類脂A結合構成的一種兩性大分子物質。在LPS分子內，親水性基團與疏水性基團在空間結構上位于分子兩端，因此，在極性溶媒和非極性溶媒中均能形成微粒樣多聚體。在水溶液中形成的LPS微膠粒，疏水性的類脂A位于多聚體的內部，親水性的多糖位于多聚體的外側（而在脂溶性的溶劑中則相反），其分子量可增大到1×108，在電鏡下呈清晰的微膠粒。在水溶液中，由于多聚體親水表面富含酸性基團，使得高分子LPS多聚體帶有負電荷。因此，LPS微膠粒能與溶媒中的Mg2+、Ca2+結合，從而增強了LPS微膠粒的結構穩定性。表面活性劑與溶媒中的Mg2+、Ca2+可影響LPS微膠粒的聚合狀態。通常在無表面活性劑存在 的溶液中，LPS多聚體的分子量超過1×106；在 表面活性劑存在時，LPS多聚體被解聚成（1～2）×104的微膠粒。
    LPS的集聚程度對于其生物學活性有非常顯著的影響。在測定LPS的活性時，必須以LPS溶解狀態為前提。在水溶液中形成的LPS微膠粒，由于其主要活性部分類脂A不暴露于水溶液中，因此必須采用一系列的方法使LPS多聚體解聚。
    對于某種特定的LPS，由于集聚程度的不同，生物學活性可強弱不一。低集聚度的LPS分子表現較強的毒性。相反，高集聚狀態的LPS多聚體，由于易被細胞吞噬清除，表現出較低的毒性。不同方法提取的LPS毒性強弱不等，酸法提取的LPS，由于部分a-糖苷鍵被裂解，形成較多游離的類脂A，因此，酸法抽提的LPS毒性較酚法提取的低。LPS其他生物學活性，如致有絲分裂反應及鱟試劑凝集反應等活性，也受到LPS集聚程度的影響，聚合狀態的LPS不能與鱟試劑發生凝集反應，必須通過各種方法將其解聚，變為LPS單體才能較好地使鱟試劑凝集。
    在LPS標準品溶解時，往往不能確定其微膠粒狀態是否被完全解聚，用旋渦振蕩器一般可以達到解聚的目的。如有條件可用20KHZ左右的聲波對LPS微膠粒進行解聚，通過此種方法可得到均勻分布的LPS單體溶液，但此種單體溶液在溶液中僅能維持約10min左右。

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