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        生物資訊

        Cell:《細胞》期刊2011年度五大研究發現

        作者:towersimper 來源:生物谷 發布時間: 2012-01-11 11:15  瀏覽次數:
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        1.利用誘導性多功能干細胞構建出小鼠精子祖細胞

         

        日本京都大學研究人員通過體外誘導胚胎干細胞(ESCs)和誘導性多功能干細胞(iPSCs),形成原始生殖細胞樣細胞(primordial germ cell-like cells, PGCLCs),最后進一步分化,通過體內植入不能生育的小鼠睪丸中,產生了外觀正常的精子。將這些精子注射到雌性小鼠的卵細胞中,不久雌性小鼠生出了健康的小鼠后代。

        Katsuhiko Hayashi et al. Reconstitution of the Mouse Germ Cell Specification Pathway in Culture by Pluripotent Stem Cells. Cell,04 August 2011,146(4):519-532, doi:10.1016/j.cell.2011.06.052.

        2.鑒定出阿爾茨海默病Alzheimer's disease的生物標記

        美國研究人員利用一種一般性和無偏差的方法---組合文庫篩選(Combinatorial Library Screening)來鑒定出診斷上有用的抗體,而避免進行抗原鑒定。該方法涉及利用非自然的合成分子組合文庫對病人血清樣品和對照樣品進行比較性篩選,這樣就可鑒定出病人血清樣品中要比和對照樣品中保留極其多IgG抗體的分子,隨后利用這些分子作為捕獲試劑來捕獲診斷上有用的抗體。研究人員利用多發性硬化癥(multiple sclerosis)小鼠模式動物和證實這種方法的實用性,并利用該方法在阿爾茨海默病小鼠模式動物中鑒定出兩種候選的IgG抗體生物標記。

        M. Muralidhar Reddy et al. Identification of Candidate IgG Biomarkers for Alzheimer's Disease via Combinatorial Library Screening. Cell, 7 January 2011, 144(1):132-142, doi:10.1016/j.cell.2010.11.054.

        3.發現干細胞多能性的選擇性剪接開關

        加拿大多倫多大學研究人員發現了進化上保守的特異的FOXP1選擇性剪接開關,可調控干細胞的多能性。研究人員發現這種剪接開關產生的FOXP1胚胎干細胞特異性異構體,與典型的FOXP1異構體相比,著不同的DNA結合性質。選擇性剪接事件改變了FOXP1胚胎干細胞特異性異構體的DNA結合性質,促進維持多能性所需的轉錄因子基因的表達,包括OCT4、NANOG、NR5A2和GDF3,同時抑制胚胎干細胞分化所需的基因。同時,研究小組還發現FOXP1胚胎干細胞特異性異構體促進體細胞高效重編程為誘導性多功能干細胞(iPSC)。

        Mathieu Gabut et al. An Alternative Splicing Switch Regulates Embryonic Stem Cell Pluripotency and Reprogramming. Cell, 15 September 2011, 147(1):132-146,
        doi:10.1016/j.cell.2011.08.023.

        4.追蹤神經膠質瘤的起源

        美國研究人員利用雙標記嵌合分析(Mosaic Analysis with Double Markers,MADM)---該技術的精髓在于用綠色熒光蛋白明確標示突變細胞,還有一個關鍵特色就是無論一個突變的綠色細胞何時產生,總是同時產生一個正常的紅色細胞---來分析神經膠質瘤(glioma)的起源。他們將膠質瘤病人體內發現的兩種流行突變p53與NF1導入神經干細胞(neural stem cells, NSCs)中,對源自神經干細胞的所有細胞系所作的進一步分析清楚地顯示了少突膠質前體細胞(Oligodendrocyte precursor cells,OPCs)是該腫瘤的來源細胞,因為任何可見的腫瘤標志可被檢出之前,變異的綠色少突膠質前體細胞的數量大大超過了其正常的紅色對應物數量,足足超了130倍。為了進一步證實這點,研究人員也將p53與NF1突變直接導入小鼠少突膠質前體細胞,結果發現這些小鼠產生神經膠質瘤,從而再次證實少突膠質前體細胞是神經膠質瘤的來源。

        Chong Liu et el. Mosaic Analysis with Double Markers Reveals Tumor Cell of Origin in Glioma. Cell, 07 July 2011,146(2):209-221,doi:10.1016/j.cell.2011.06.014.

        5.發現新的組蛋白修飾方式

        美國芝加哥大學Ben Mary癌癥研究所研究人員在細胞中篩查出了67個新組蛋白修飾標記,并從中發現了一種新型組蛋白翻譯后修飾方式---賴氨酸巴豆酰化(lysine crotonylation)修飾。通過進一步的結構及基因組定位分析,研究人員證實氨酸巴豆?;揎検且环N進化高度保守,且在生物學功能上完全不同于組蛋白賴氨酸乙酰化的蛋白質修飾方式。研究人員還發現在人類體細胞和小鼠精子細胞基因組中,組蛋白賴氨酸巴豆酰化分布于基因活性轉錄啟動區域或增強子上。在減數分裂后的精子細胞中,賴氨酸巴豆?;哓S度集中在性染色體上,被用來標記睪丸特異性基因。(生物谷:towersimper編譯)

        Minjia Tan et al. Identification of 67 Histone Marks and Histone Lysine Crotonylation as a New Type of Histone Modification. Cell, 16 September 2011, 146(6):1016-1028, doi:10.1016/j.cell.2011.08.008.

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